Hallo Mario,
ich würde auch eine Klebevariante einer Gummidichtung nehmen.
Acryl aus dem Grund nicht, da es a.) relativ schnell nachgilbt, wenn es nicht beschichtet wird (Lack oder Wandfarbe z.B.) und b.) nicht Schimmelfest ist (auch, wenn der Hersteller "Schimmelfrei" drauf schreibt).
Und Silikon nicht, weil die Inhaltsstoffe dir in das Paulownia ziehen und einen unansehnlichen Rand hinterlassen können. Silikon hat im Innenbereich seine Daseins-Berechtigung als Fuge im Keramikbereich (Bad, Küche) und maximal im Außenbereich an Anschlüssen zum Fenster hin (z.B. Klinker und Fenster). Ansonsten ist das "normale" Silikon untauglich für solche Vorhaben.
Was gehen würde, wäre Coltagum Bodenfuge:
http://www.coltogum.ch/produkte/dichten/bodenfuge/Allerdings gibt es das als "Bodenfuge" nicht im Farbton Paulownia. Da müsstest Du den Farbton selber raus suchen und entscheiden.